В мочеполовых органах лиц, в прошлом перенёсших ИППП, изменяются эластические и аргирофильные волокна. В местах инфильтратов они утолщены, прерываются, теряют ветвистость. Обнаруживается также клеточный инфильтрат, который состоит преимущественно из лимфоцитов с примесью гистиоцитов, единичных сегментоядерных лейкоцитов и плазматических клеток. Установлено, что в клетках воспалительных инфильтратов накапливается ДНК и кислые мукополисахариды, а также вещества, входящие в состав антител – РНК и нейтральные мукополисахариды. Этот инфильтрат можно рассматривать как проявление аллергической реакции замедленного типа, в которой сенсибилизированные лимфоциты осуществляют клеточную форму иммунного ответа, а плазматические клетки синтезируют гуморальные антитела непосредственно в очаге поражения. Наряду с этим осуществляется и обострение воспалительного процесса в тканях, что проявляется наличием в них сегментоядерных лейкоцитов, накоплением в них ДНК и кислых мукополисахаридов. В очагах воспаления, кроме ДНК и кислых мукополисахаридов, накапливаются вещества, входящие в состав антител РНК и нейтральные мукополисахариды. Следовательно, в результате хронического воспаления развиваются и иммуноморфологические процессы, которые в последующем также способствуют развитию дистрофических изменений в тканях с исходом в склероз. В контрольных препаратах трупного и операционного материала подобных морфологических изменений не выявлено. На фоне морфологически изменённых тканей мочеполовых органов могут усиленно размножаться и проявлять вирулентные свойства условно-патогенные микроорганизмы нормальной микрофлоры уретры, а также микробы, которые попадают в мочеиспускательный канал вместе с ИППП. Это постоянно способствует обострению воспалительного процесса в тканях, сопровождающегося дистрофическими, некротическими процессами в них. Разрушенные ткани становятся полноценными антигенами, против которых нарабатываются аутоантитела. Следовательно, процесс принимает и аутоагрессивный характер, что вызывает стойкие, порой необратимые изменения в мочеполовых органах.